В начале XX века музей организовал несколько важных археологических и антропологических экспедиций в Египет, Месопотамию, Африку, Восточную Азию и Латинскую Америку; материалы экспедиций составили часть экспозиции музея.

Музей насчитывает 6 млн единиц хранения, 500 тысяч фотодокументов, несколько тысяч аудиозаписей. В музее имеется архив из более 500 тысяч изображений, относящихся к туземным культурам Америки и Океании.

Более 1600 экспонатов представляют стелы, керамику, украшения, ткани, предметы культа и быта, гравюры, книги, исторические документы, а также наследие доисторического периода

Содержит коллекцию из 120 тысяч объектов и изображений, относящихся к материальной культуре Американского континента, прежде всего Бразилии, а также Средиземноморья, Ближнего Востока и Африки с доисторических времён до настоящего времени.

Коллекция музея разделена на четыре раздела: искусство, история, археология и этнография. В коллекции представлено как колумбийское искусство, так и латиноамериканское и европейское, в том числе картины, рисунки, гравюры,скульптуры, инсталляции и предметы декоративно-прикладного искусства от колониального периода до наших дней.